但是，在元和元年(1615年) ，随着丰臣大坂之役的灭亡，大坂城被全部烧毁了。随后江户元和6年(1620年) ，德川幕府开始重建江户大坂城。搭上幕府的威信，历时10年建成的大坂城与丰臣秀吉所造的完全不同。此时的大阪城，在周围堆砌了大规模的石墙，且绕城挖凿造了护城河，并还将天守阁再加高了15米。
但是这座天守阁也因为宽文5年(1665年)的雷击被烧毁了，且没有重建。其他建筑物也于明治维新(1886年)的动乱，被烧毁了。最后只剩下了大手门和塔楼等部分。

昭和6年(1931年) ，根据当时的市长的提议，通过对市民募捐，重建了天守阁。但后来又因战争的空袭，几座建筑物被烧毁了，同时天守阁也各处遭到了破坏。最后大阪城于平成9年进行了「平成大修」，大阪城也进化成了如今我们所看到的样子。